Peptidomimetyczne bloki konstrukcyjne

Znanym przykładem interakcji regulacyjnej RNA-białko jest kompleks TAR-RNA HIV-1 i białko wirusowe Tat. Ten kompleks jest ważny dla skutecznej transkrypcji genomu wirusa. Znajomość zasad rozpoznawania Tat to TAR RNA powinna umożliwić projektowanie konkretnych ligandów, które mogą atakować jako antiviralni antagoniści Tat. Celem pracy była synteza ligandów RNA do syntezy peptydów fazy stałej (FPPS) w oparciu o heteroaromatyczne bloki konstrukcyjne. Podobieństwa wiążące peptydów i małych cząsteczek z FPPS do TAR RNA HIV-1 określono metodą fluorescencyjną i fluorescencyjną spektroskopią korelacyjną (FCS). Badania NMR i dynamiczne obliczenia molekularne umożliwiły wykrycie zmiany konformacyjnej w TAR RNA. Właściwości przeciwwirusowe peptydów i małych cząsteczek określono metodą oznaczania komórek HeLa P4. Kolejnym celem pracy było zbadanie koncepcji wiązania i właściwości przeciwwirusowych diaminopyrazoli i indazoli.