Computational Epitopes-Based Vaccine against Sin Nombre Virus

Wirus Sin Numbre jest patogenem kategorii A, którego śmiertelność waha się od 30% do 50%. Był on odpowiedzialny za wybuch epidemii w parku narodowym Yosemite w 2012 roku. Dotychczas w leczeniu HCPS wywołanego przez SNV nie była dostępna terapia specyficzna. Pomimo wielu wysiłków zmierzających do opracowania bezpiecznych i skutecznych szczepionek przeciwko wirusowi SNV, w tym zarówno konwencjonalnych, jak i molekularnych, jak dotąd nie ma szczepionek, których skuteczność wobec wirusa SNV została potwierdzona. W naszych badaniach analizowaliśmy glikoproteinę otoczkową i nukleokapid wirusa SNV przy użyciu narzędzi immunoinformatycznych znajdujących się w zasobach IEDB; w celu określenia najbardziej zachowanych i immunogennych epitopów dla komórek B i T. Następnie dokonano oceny przewidywanych epitopów pod względem pokrycia populacji na tle całej populacji światowej z ograniczonymi allelami MHC-I i MHC-II. Wśród przewidywanych epitopów dla komórek B najlepszymi kandydatami na glikoproteinę i nuklokapid były odpowiednio epitopy 743CKKYAYPWQT752 i 271QVDESKVS278.